海洋能发电与应用技术研究部由海洋能发电与应用技术研究组、海洋电机系统研究组和智能海洋电气研究组组成，致力于海洋和空间装备能源动力系统前沿技术研究。研究方向包括海洋能发电，海洋船舶推进，空间电源技术，脉冲磁流体发电。承担多项国家863课题、中科院先导项目、国家自然科学基金、国家海洋可再生能源专项、国家预研以及企业委托技术研发课题。 

       针对目前波浪能发电技术中转换效率和可靠性低的颈瓶，创新性地提出波浪能直接发电技术。已研制成功装机容量10kW的磁流体波浪能发电海试样机，在南海海域进行了实海况测试。该技术被认为是“波浪能转换技术的重要创新性突破”。针对深海供电难题，开展了深海海流能发电研究，完成了近海试验。 

       针对船舶降噪的难题，研发一种全新的磁流体喷水推进装置，实现船舶无机械运动部件的高安静航行。已研制成功磁流体推进试验船，进行了水池航行测试。 

       针对大功率电源技术的颈瓶，研发一种新型静态核电转换技术，通过磁流体发电技术，将热能直接转换成电能。解决传统静态电能转换技术中功率和效率难以大幅提高的难题，实现百千瓦级以上的空间电源技术。已研制成功我国第一台盘式磁流体发电机，完成发电试验，输出功率10.3kW，处于同类装置的世界第三水平。 

       研究部创新研究成果显著，先后研制了中国第一艘超导磁流体推进船HEMS-1，1000N电磁推力的磁流体推进器，10kW磁流体波浪能发电海试样机，20m3/h的电磁流体薄油膜回收装置工程样机，10kW盘式磁流体发电机。在磁流体发电、磁流体推进、多相流流动、永磁电机，以及波浪能和潮流能发电系统设计、仿真和试验等方面拥有一批成果，获中国科学院科技进步二等奖等多项奖励。